Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX66

Dpf1, Zinc finger protein neuro-d4, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf1Q9QX66 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dpf1Q9QX66 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dpf1Q9QX66 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dpf1Q9QX66 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Dpf1Q9QX66 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dpf1Q9QX66 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dpf1Q9QX66 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Dpf1Q9QX66 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Dpf1Q9QX66 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Dpf1Q9QX66 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Dpf1Q9QX66 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Dpf1Q9QX66 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Dpf1Q9QX66 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Dpf1Q9QX66 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Dpf1Q9QX66 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Dpf1Q9QX66 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Dpf1Q9QX66 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Dpf1Q9QX66 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Dpf1Q9QX66 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Dpf1Q9QX66 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Dpf1Q9QX66 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Dpf1Q9QX66 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Dpf1Q9QX66 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Dpf1Q9QX66 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Dpf1Q9QX66 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dpf1Q9QX66 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dpf1Q9QX66 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dpf1Q9QX66 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dpf1Q9QX66 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dpf1Q9QX66 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dpf1Q9QX66 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dpf1Q9QX66 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Dpf1Q9QX66 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Dpf1Q9QX66 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Dpf1Q9QX66 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Dpf1Q9QX66 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Dpf1Q9QX66 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Dpf1Q9QX66 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Dpf1Q9QX66 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Dpf1Q9QX66 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Dpf1Q9QX66 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Dpf1Q9QX66 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Dpf1Q9QX66 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Dpf1Q9QX66 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Dpf1Q9QX66 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Dpf1Q9QX66 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Dpf1Q9QX66 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Dpf1Q9QX66 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Dpf1Q9QX66 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Dpf1Q9QX66 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Dpf1Q9QX66 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Dpf1Q9QX66 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Dpf1Q9QX66 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Dpf1Q9QX66 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Dpf1Q9QX66 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dpf1Q9QX66 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dpf1Q9QX66 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dpf1Q9QX66 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dpf1Q9QX66 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dpf1Q9QX66 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dpf1Q9QX66 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dpf1Q9QX66 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Dpf1Q9QX66 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dpf1Q9QX66 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dpf1Q9QX66 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dpf1Q9QX66 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Dpf1Q9QX66 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Dpf1Q9QX66 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Dpf1Q9QX66 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Dpf1Q9QX66 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dpf1Q9QX66 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms