Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trpc5Q9QX29 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trpc5Q9QX29 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trpc5Q9QX29 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trpc5Q9QX29 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trpc5Q9QX29 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trpc5Q9QX29 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Trpc5Q9QX29 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpc5Q9QX29 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trpc5Q9QX29 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trpc5Q9QX29 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trpc5Q9QX29 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trpc5Q9QX29 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpc5Q9QX29 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trpc5Q9QX29 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trpc5Q9QX29 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpc5Q9QX29 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpc5Q9QX29 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpc5Q9QX29 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpc5Q9QX29 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpc5Q9QX29 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpc5Q9QX29 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpc5Q9QX29 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpc5Q9QX29 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpc5Q9QX29 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpc5Q9QX29 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpc5Q9QX29 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpc5Q9QX29 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpc5Q9QX29 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trpc5Q9QX29 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trpc5Q9QX29 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trpc5Q9QX29 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trpc5Q9QX29 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trpc5Q9QX29 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpc5Q9QX29 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpc5Q9QX29 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpc5Q9QX29 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpc5Q9QX29 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpc5Q9QX29 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpc5Q9QX29 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpc5Q9QX29 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms