Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phc2Q9QWH1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phc2Q9QWH1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phc2Q9QWH1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phc2Q9QWH1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phc2Q9QWH1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phc2Q9QWH1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phc2Q9QWH1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phc2Q9QWH1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phc2Q9QWH1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phc2Q9QWH1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phc2Q9QWH1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phc2Q9QWH1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phc2Q9QWH1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phc2Q9QWH1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phc2Q9QWH1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phc2Q9QWH1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phc2Q9QWH1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phc2Q9QWH1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phc2Q9QWH1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phc2Q9QWH1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phc2Q9QWH1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phc2Q9QWH1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phc2Q9QWH1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phc2Q9QWH1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phc2Q9QWH1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Phc2Q9QWH1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Phc2Q9QWH1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms