Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM4

Slamf1, Signaling lymphocytic activation molecule, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slamf1Q9QUM4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slamf1Q9QUM4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slamf1Q9QUM4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slamf1Q9QUM4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slamf1Q9QUM4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slamf1Q9QUM4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Slamf1Q9QUM4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slamf1Q9QUM4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slamf1Q9QUM4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slamf1Q9QUM4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slamf1Q9QUM4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slamf1Q9QUM4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slamf1Q9QUM4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slamf1Q9QUM4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slamf1Q9QUM4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slamf1Q9QUM4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slamf1Q9QUM4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slamf1Q9QUM4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slamf1Q9QUM4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slamf1Q9QUM4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slamf1Q9QUM4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slamf1Q9QUM4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Slamf1Q9QUM4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slamf1Q9QUM4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slamf1Q9QUM4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slamf1Q9QUM4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slamf1Q9QUM4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slamf1Q9QUM4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms