Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc2lQ9JME7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms