Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Higd1aQ9JLR9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1aQ9JLR9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms