Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Col5a3Q9JLI2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col5a3Q9JLI2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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