Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gde1Q9JL56 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gde1Q9JL56 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gde1Q9JL56 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gde1Q9JL56 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gde1Q9JL56 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gde1Q9JL56 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gde1Q9JL56 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gde1Q9JL56 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gde1Q9JL56 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gde1Q9JL56 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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