Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV7

Extl1, Exostosin-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl1Q9JKV7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Extl1Q9JKV7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Extl1Q9JKV7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Extl1Q9JKV7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Extl1Q9JKV7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Extl1Q9JKV7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Extl1Q9JKV7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Extl1Q9JKV7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Extl1Q9JKV7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Extl1Q9JKV7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Extl1Q9JKV7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Extl1Q9JKV7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Extl1Q9JKV7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Extl1Q9JKV7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Extl1Q9JKV7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Extl1Q9JKV7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Extl1Q9JKV7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Extl1Q9JKV7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Extl1Q9JKV7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Extl1Q9JKV7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Extl1Q9JKV7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Extl1Q9JKV7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Extl1Q9JKV7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Extl1Q9JKV7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Extl1Q9JKV7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Extl1Q9JKV7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Extl1Q9JKV7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Extl1Q9JKV7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Extl1Q9JKV7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Extl1Q9JKV7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms