Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ldb3Q9JKS4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ldb3Q9JKS4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ldb3Q9JKS4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms