Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uchl3Q9JKB1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uchl3Q9JKB1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uchl3Q9JKB1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uchl3Q9JKB1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Uchl3Q9JKB1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Uchl3Q9JKB1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uchl3Q9JKB1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uchl3Q9JKB1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uchl3Q9JKB1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uchl3Q9JKB1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uchl3Q9JKB1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uchl3Q9JKB1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Uchl3Q9JKB1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uchl3Q9JKB1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uchl3Q9JKB1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uchl3Q9JKB1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uchl3Q9JKB1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uchl3Q9JKB1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uchl3Q9JKB1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Uchl3Q9JKB1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uchl3Q9JKB1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Uchl3Q9JKB1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uchl3Q9JKB1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uchl3Q9JKB1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Uchl3Q9JKB1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Uchl3Q9JKB1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uchl3Q9JKB1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uchl3Q9JKB1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uchl3Q9JKB1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uchl3Q9JKB1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uchl3Q9JKB1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uchl3Q9JKB1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Uchl3Q9JKB1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uchl3Q9JKB1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uchl3Q9JKB1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uchl3Q9JKB1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uchl3Q9JKB1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.1 ms