Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sh3bgrlQ9JJU8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bgrlQ9JJU8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms