Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bco1Q9JJS6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Bco1Q9JJS6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Bco1Q9JJS6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bco1Q9JJS6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bco1Q9JJS6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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