Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpf2Q9JJ80 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpf2Q9JJ80 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms