Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc12a4Q9JIS8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc12a4Q9JIS8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc12a4Q9JIS8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc12a4Q9JIS8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc12a4Q9JIS8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc12a4Q9JIS8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc12a4Q9JIS8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc12a4Q9JIS8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc12a4Q9JIS8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc12a4Q9JIS8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc12a4Q9JIS8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc12a4Q9JIS8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc12a4Q9JIS8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc12a4Q9JIS8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc12a4Q9JIS8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc12a4Q9JIS8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc12a4Q9JIS8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc12a4Q9JIS8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc12a4Q9JIS8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc12a4Q9JIS8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc12a4Q9JIS8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc12a4Q9JIS8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc12a4Q9JIS8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc12a4Q9JIS8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc12a4Q9JIS8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc12a4Q9JIS8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms