Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pus3Q9JI38 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pus3Q9JI38 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pus3Q9JI38 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pus3Q9JI38 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pus3Q9JI38 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pus3Q9JI38 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pus3Q9JI38 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pus3Q9JI38 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pus3Q9JI38 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pus3Q9JI38 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms