Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tssc4Q9JHE7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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Tssc4Q9JHE7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tssc4Q9JHE7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
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Tssc4Q9JHE7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Tssc4Q9JHE7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tssc4Q9JHE7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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