Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Brd4Q9ESU6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Brd4Q9ESU6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Brd4Q9ESU6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Brd4Q9ESU6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Brd4Q9ESU6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Brd4Q9ESU6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Brd4Q9ESU6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Brd4Q9ESU6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Brd4Q9ESU6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Brd4Q9ESU6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Brd4Q9ESU6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Brd4Q9ESU6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Brd4Q9ESU6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Brd4Q9ESU6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Brd4Q9ESU6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC38.57■■■■□ 3.77
Brd4Q9ESU6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Brd4Q9ESU6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
Brd4Q9ESU6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Brd4Q9ESU6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Brd4Q9ESU6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Brd4Q9ESU6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Brd4Q9ESU6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Brd4Q9ESU6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Brd4Q9ESU6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Brd4Q9ESU6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Brd4Q9ESU6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Brd4Q9ESU6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Brd4Q9ESU6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Brd4Q9ESU6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Brd4Q9ESU6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Brd4Q9ESU6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
Brd4Q9ESU6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Brd4Q9ESU6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Brd4Q9ESU6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Brd4Q9ESU6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Brd4Q9ESU6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Brd4Q9ESU6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Brd4Q9ESU6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Brd4Q9ESU6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Brd4Q9ESU6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Brd4Q9ESU6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Brd4Q9ESU6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Brd4Q9ESU6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Brd4Q9ESU6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Brd4Q9ESU6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Brd4Q9ESU6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
Brd4Q9ESU6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Brd4Q9ESU6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Brd4Q9ESU6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Brd4Q9ESU6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Brd4Q9ESU6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Brd4Q9ESU6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Brd4Q9ESU6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Brd4Q9ESU6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Brd4Q9ESU6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Brd4Q9ESU6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Brd4Q9ESU6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Brd4Q9ESU6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Brd4Q9ESU6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Brd4Q9ESU6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Brd4Q9ESU6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
Brd4Q9ESU6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Brd4Q9ESU6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Brd4Q9ESU6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
Brd4Q9ESU6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Brd4Q9ESU6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Brd4Q9ESU6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Brd4Q9ESU6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Brd4Q9ESU6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Brd4Q9ESU6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Brd4Q9ESU6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
Brd4Q9ESU6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Brd4Q9ESU6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Brd4Q9ESU6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Brd4Q9ESU6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Brd4Q9ESU6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Brd4Q9ESU6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Brd4Q9ESU6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Brd4Q9ESU6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Brd4Q9ESU6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Brd4Q9ESU6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Brd4Q9ESU6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
Brd4Q9ESU6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
Brd4Q9ESU6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Brd4Q9ESU6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
Brd4Q9ESU6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Brd4Q9ESU6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Brd4Q9ESU6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Brd4Q9ESU6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Brd4Q9ESU6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
Brd4Q9ESU6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Brd4Q9ESU6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
Brd4Q9ESU6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Brd4Q9ESU6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Brd4Q9ESU6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Brd4Q9ESU6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Brd4Q9ESU6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Brd4Q9ESU6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Brd4Q9ESU6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms