Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cmtm7Q9ESD6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cmtm7Q9ESD6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cmtm7Q9ESD6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cmtm7Q9ESD6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cmtm7Q9ESD6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cmtm7Q9ESD6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm7Q9ESD6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm7Q9ESD6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm7Q9ESD6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm7Q9ESD6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm7Q9ESD6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm7Q9ESD6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm7Q9ESD6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm7Q9ESD6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cmtm7Q9ESD6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cmtm7Q9ESD6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cmtm7Q9ESD6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cmtm7Q9ESD6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cmtm7Q9ESD6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms