Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES82

Popdc2, Popeye domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Popdc2Q9ES82 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Popdc2Q9ES82 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Popdc2Q9ES82 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Popdc2Q9ES82 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Popdc2Q9ES82 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Popdc2Q9ES82 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Popdc2Q9ES82 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Popdc2Q9ES82 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Popdc2Q9ES82 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Popdc2Q9ES82 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Popdc2Q9ES82 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Popdc2Q9ES82 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Popdc2Q9ES82 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Popdc2Q9ES82 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Popdc2Q9ES82 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Popdc2Q9ES82 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Popdc2Q9ES82 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Popdc2Q9ES82 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Popdc2Q9ES82 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Popdc2Q9ES82 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Popdc2Q9ES82 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Popdc2Q9ES82 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Popdc2Q9ES82 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Popdc2Q9ES82 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Popdc2Q9ES82 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Popdc2Q9ES82 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Popdc2Q9ES82 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Popdc2Q9ES82 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Popdc2Q9ES82 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Popdc2Q9ES82 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Popdc2Q9ES82 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Popdc2Q9ES82 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Popdc2Q9ES82 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Popdc2Q9ES82 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Popdc2Q9ES82 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Popdc2Q9ES82 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Popdc2Q9ES82 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Popdc2Q9ES82 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms