Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kcnn1Q9EQR3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kcnn1Q9EQR3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kcnn1Q9EQR3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kcnn1Q9EQR3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kcnn1Q9EQR3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kcnn1Q9EQR3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kcnn1Q9EQR3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kcnn1Q9EQR3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kcnn1Q9EQR3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kcnn1Q9EQR3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kcnn1Q9EQR3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kcnn1Q9EQR3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kcnn1Q9EQR3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kcnn1Q9EQR3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kcnn1Q9EQR3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kcnn1Q9EQR3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kcnn1Q9EQR3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kcnn1Q9EQR3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kcnn1Q9EQR3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kcnn1Q9EQR3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kcnn1Q9EQR3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kcnn1Q9EQR3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kcnn1Q9EQR3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kcnn1Q9EQR3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kcnn1Q9EQR3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kcnn1Q9EQR3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kcnn1Q9EQR3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kcnn1Q9EQR3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kcnn1Q9EQR3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kcnn1Q9EQR3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kcnn1Q9EQR3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kcnn1Q9EQR3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kcnn1Q9EQR3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Kcnn1Q9EQR3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kcnn1Q9EQR3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kcnn1Q9EQR3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kcnn1Q9EQR3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kcnn1Q9EQR3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kcnn1Q9EQR3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kcnn1Q9EQR3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kcnn1Q9EQR3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kcnn1Q9EQR3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kcnn1Q9EQR3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kcnn1Q9EQR3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kcnn1Q9EQR3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kcnn1Q9EQR3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kcnn1Q9EQR3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kcnn1Q9EQR3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kcnn1Q9EQR3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kcnn1Q9EQR3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kcnn1Q9EQR3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kcnn1Q9EQR3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kcnn1Q9EQR3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kcnn1Q9EQR3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kcnn1Q9EQR3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kcnn1Q9EQR3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kcnn1Q9EQR3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kcnn1Q9EQR3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kcnn1Q9EQR3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kcnn1Q9EQR3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kcnn1Q9EQR3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kcnn1Q9EQR3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kcnn1Q9EQR3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms