Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ndufs3Q9DCT2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufs3Q9DCT2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ndufs3Q9DCT2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ndufs3Q9DCT2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufs3Q9DCT2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufs3Q9DCT2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms