Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cpne8Q9DC53 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpne8Q9DC53 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpne8Q9DC53 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms