Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc46a3Q9DC26 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc46a3Q9DC26 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc46a3Q9DC26 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc46a3Q9DC26 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc46a3Q9DC26 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc46a3Q9DC26 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc46a3Q9DC26 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc46a3Q9DC26 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms