Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf6Q9DBU5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf6Q9DBU5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf6Q9DBU5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf6Q9DBU5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf6Q9DBU5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf6Q9DBU5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf6Q9DBU5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf6Q9DBU5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf6Q9DBU5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf6Q9DBU5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf6Q9DBU5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf6Q9DBU5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf6Q9DBU5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf6Q9DBU5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf6Q9DBU5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf6Q9DBU5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf6Q9DBU5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf6Q9DBU5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf6Q9DBU5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf6Q9DBU5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf6Q9DBU5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf6Q9DBU5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf6Q9DBU5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf6Q9DBU5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf6Q9DBU5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf6Q9DBU5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf6Q9DBU5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms