Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SrpraQ9DBG7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrpraQ9DBG7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrpraQ9DBG7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrpraQ9DBG7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrpraQ9DBG7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrpraQ9DBG7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrpraQ9DBG7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrpraQ9DBG7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SrpraQ9DBG7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrpraQ9DBG7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrpraQ9DBG7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrpraQ9DBG7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrpraQ9DBG7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrpraQ9DBG7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrpraQ9DBG7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrpraQ9DBG7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrpraQ9DBG7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrpraQ9DBG7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrpraQ9DBG7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrpraQ9DBG7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrpraQ9DBG7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrpraQ9DBG7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SrpraQ9DBG7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SrpraQ9DBG7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms