Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SelenooQ9DBC0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SelenooQ9DBC0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SelenooQ9DBC0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms