Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Med29Q9DB91 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Med29Q9DB91 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms