Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU9

Znf654, Zinc finger protein 654, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf654Q9DAU9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf654Q9DAU9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf654Q9DAU9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf654Q9DAU9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms