Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem239Q9DA47 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem239Q9DA47 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem239Q9DA47 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms