Protein–RNA interactions for Protein: Q9D994

Wdr38, WD repeat-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr38Q9D994 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Wdr38Q9D994 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Wdr38Q9D994 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr38Q9D994 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr38Q9D994 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr38Q9D994 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr38Q9D994 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms