Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Srp19Q9D7A6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Srp19Q9D7A6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.6 ms