Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MsraQ9D6Y7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MsraQ9D6Y7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MsraQ9D6Y7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MsraQ9D6Y7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MsraQ9D6Y7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MsraQ9D6Y7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MsraQ9D6Y7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MsraQ9D6Y7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MsraQ9D6Y7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MsraQ9D6Y7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MsraQ9D6Y7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MsraQ9D6Y7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MsraQ9D6Y7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MsraQ9D6Y7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MsraQ9D6Y7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MsraQ9D6Y7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MsraQ9D6Y7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MsraQ9D6Y7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MsraQ9D6Y7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MsraQ9D6Y7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MsraQ9D6Y7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MsraQ9D6Y7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MsraQ9D6Y7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MsraQ9D6Y7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MsraQ9D6Y7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MsraQ9D6Y7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MsraQ9D6Y7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MsraQ9D6Y7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MsraQ9D6Y7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MsraQ9D6Y7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MsraQ9D6Y7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MsraQ9D6Y7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MsraQ9D6Y7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MsraQ9D6Y7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MsraQ9D6Y7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MsraQ9D6Y7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MsraQ9D6Y7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MsraQ9D6Y7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MsraQ9D6Y7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MsraQ9D6Y7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MsraQ9D6Y7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MsraQ9D6Y7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MsraQ9D6Y7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MsraQ9D6Y7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MsraQ9D6Y7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MsraQ9D6Y7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MsraQ9D6Y7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MsraQ9D6Y7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MsraQ9D6Y7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MsraQ9D6Y7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MsraQ9D6Y7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MsraQ9D6Y7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MsraQ9D6Y7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MsraQ9D6Y7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MsraQ9D6Y7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MsraQ9D6Y7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MsraQ9D6Y7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MsraQ9D6Y7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MsraQ9D6Y7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MsraQ9D6Y7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MsraQ9D6Y7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MsraQ9D6Y7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MsraQ9D6Y7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MsraQ9D6Y7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MsraQ9D6Y7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MsraQ9D6Y7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MsraQ9D6Y7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MsraQ9D6Y7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MsraQ9D6Y7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MsraQ9D6Y7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MsraQ9D6Y7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MsraQ9D6Y7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MsraQ9D6Y7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MsraQ9D6Y7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MsraQ9D6Y7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MsraQ9D6Y7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MsraQ9D6Y7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MsraQ9D6Y7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MsraQ9D6Y7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MsraQ9D6Y7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MsraQ9D6Y7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms