Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zcchc13Q9D548 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zcchc13Q9D548 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zcchc13Q9D548 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zcchc13Q9D548 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zcchc13Q9D548 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zcchc13Q9D548 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zcchc13Q9D548 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zcchc13Q9D548 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zcchc13Q9D548 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zcchc13Q9D548 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zcchc13Q9D548 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zcchc13Q9D548 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Zcchc13Q9D548 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zcchc13Q9D548 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zcchc13Q9D548 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zcchc13Q9D548 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zcchc13Q9D548 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Zcchc13Q9D548 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zcchc13Q9D548 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zcchc13Q9D548 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zcchc13Q9D548 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Zcchc13Q9D548 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zcchc13Q9D548 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zcchc13Q9D548 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zcchc13Q9D548 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zcchc13Q9D548 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Zcchc13Q9D548 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Zcchc13Q9D548 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zcchc13Q9D548 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zcchc13Q9D548 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zcchc13Q9D548 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Zcchc13Q9D548 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Zcchc13Q9D548 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Zcchc13Q9D548 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Zcchc13Q9D548 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zcchc13Q9D548 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Zcchc13Q9D548 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Zcchc13Q9D548 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Zcchc13Q9D548 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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