Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc7Q9D541 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ccdc7Q9D541 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc7Q9D541 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc7Q9D541 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc7Q9D541 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc7Q9D541 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc7Q9D541 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc7Q9D541 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc7Q9D541 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc7Q9D541 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc7Q9D541 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc7Q9D541 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc7Q9D541 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc7Q9D541 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc7Q9D541 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc7Q9D541 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc7Q9D541 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc7Q9D541 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc7Q9D541 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms