Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930564D02RikQ9D4S4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 282.4 ms