Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc105Q9D4K7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc105Q9D4K7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms