Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubgcp4Q9D4F8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubgcp4Q9D4F8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms