Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
4933402E13RikQ9D4D2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
4933402E13RikQ9D4D2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
4933402E13RikQ9D4D2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
4933402E13RikQ9D4D2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
4933402E13RikQ9D4D2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
4933402E13RikQ9D4D2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4933402E13RikQ9D4D2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4933402E13RikQ9D4D2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4933402E13RikQ9D4D2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4933402E13RikQ9D4D2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
4933402E13RikQ9D4D2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4933402E13RikQ9D4D2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4933402E13RikQ9D4D2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4933402E13RikQ9D4D2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4933402E13RikQ9D4D2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4933402E13RikQ9D4D2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
4933402E13RikQ9D4D2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4933402E13RikQ9D4D2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4933402E13RikQ9D4D2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4933402E13RikQ9D4D2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
4933402E13RikQ9D4D2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
4933402E13RikQ9D4D2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
4933402E13RikQ9D4D2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
4933402E13RikQ9D4D2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4933402E13RikQ9D4D2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
4933402E13RikQ9D4D2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
4933402E13RikQ9D4D2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4933402E13RikQ9D4D2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4933402E13RikQ9D4D2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
4933402E13RikQ9D4D2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4933402E13RikQ9D4D2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
4933402E13RikQ9D4D2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
4933402E13RikQ9D4D2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4933402E13RikQ9D4D2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
4933402E13RikQ9D4D2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4933402E13RikQ9D4D2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4933402E13RikQ9D4D2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
4933402E13RikQ9D4D2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4933402E13RikQ9D4D2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4933402E13RikQ9D4D2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4933402E13RikQ9D4D2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4933402E13RikQ9D4D2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4933402E13RikQ9D4D2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4933402E13RikQ9D4D2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
4933402E13RikQ9D4D2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4933402E13RikQ9D4D2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4933402E13RikQ9D4D2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4933402E13RikQ9D4D2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4933402E13RikQ9D4D2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
4933402E13RikQ9D4D2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4933402E13RikQ9D4D2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
4933402E13RikQ9D4D2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
4933402E13RikQ9D4D2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
4933402E13RikQ9D4D2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4933402E13RikQ9D4D2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4933402E13RikQ9D4D2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
4933402E13RikQ9D4D2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
4933402E13RikQ9D4D2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4933402E13RikQ9D4D2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
4933402E13RikQ9D4D2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4933402E13RikQ9D4D2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
4933402E13RikQ9D4D2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4933402E13RikQ9D4D2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4933402E13RikQ9D4D2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
4933402E13RikQ9D4D2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
4933402E13RikQ9D4D2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
4933402E13RikQ9D4D2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
4933402E13RikQ9D4D2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
4933402E13RikQ9D4D2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms