Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Cfap53Q9D439 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cfap53Q9D439 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms