Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700034E13RikQ9D2T6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
1700034E13RikQ9D2T6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700034E13RikQ9D2T6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700034E13RikQ9D2T6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700034E13RikQ9D2T6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700034E13RikQ9D2T6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700034E13RikQ9D2T6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700034E13RikQ9D2T6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700034E13RikQ9D2T6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700034E13RikQ9D2T6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700034E13RikQ9D2T6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700034E13RikQ9D2T6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700034E13RikQ9D2T6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700034E13RikQ9D2T6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700034E13RikQ9D2T6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700034E13RikQ9D2T6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700034E13RikQ9D2T6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
1700034E13RikQ9D2T6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
1700034E13RikQ9D2T6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
1700034E13RikQ9D2T6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700034E13RikQ9D2T6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
1700034E13RikQ9D2T6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms