Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chordc1Q9D1P4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chordc1Q9D1P4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chordc1Q9D1P4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms