Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdca7Q9D0M2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdca7Q9D0M2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdca7Q9D0M2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdca7Q9D0M2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdca7Q9D0M2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdca7Q9D0M2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdca7Q9D0M2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdca7Q9D0M2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdca7Q9D0M2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdca7Q9D0M2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdca7Q9D0M2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdca7Q9D0M2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdca7Q9D0M2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdca7Q9D0M2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdca7Q9D0M2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdca7Q9D0M2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdca7Q9D0M2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdca7Q9D0M2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdca7Q9D0M2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdca7Q9D0M2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdca7Q9D0M2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdca7Q9D0M2 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdca7Q9D0M2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdca7Q9D0M2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdca7Q9D0M2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdca7Q9D0M2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdca7Q9D0M2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdca7Q9D0M2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdca7Q9D0M2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdca7Q9D0M2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdca7Q9D0M2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdca7Q9D0M2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdca7Q9D0M2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdca7Q9D0M2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdca7Q9D0M2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdca7Q9D0M2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdca7Q9D0M2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdca7Q9D0M2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdca7Q9D0M2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdca7Q9D0M2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdca7Q9D0M2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdca7Q9D0M2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdca7Q9D0M2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdca7Q9D0M2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdca7Q9D0M2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdca7Q9D0M2 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdca7Q9D0M2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdca7Q9D0M2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdca7Q9D0M2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdca7Q9D0M2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdca7Q9D0M2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdca7Q9D0M2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdca7Q9D0M2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdca7Q9D0M2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdca7Q9D0M2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdca7Q9D0M2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdca7Q9D0M2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdca7Q9D0M2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdca7Q9D0M2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdca7Q9D0M2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdca7Q9D0M2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdca7Q9D0M2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdca7Q9D0M2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdca7Q9D0M2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdca7Q9D0M2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdca7Q9D0M2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdca7Q9D0M2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdca7Q9D0M2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdca7Q9D0M2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdca7Q9D0M2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdca7Q9D0M2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdca7Q9D0M2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms