Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpsap1Q9D0M1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prpsap1Q9D0M1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpsap1Q9D0M1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpsap1Q9D0M1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms