Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mdm1Q9D067 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mdm1Q9D067 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mdm1Q9D067 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.5 ms