Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZK6

Anks3, Ankyrin repeat and SAM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Anks3Q9CZK6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Anks3Q9CZK6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Anks3Q9CZK6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Anks3Q9CZK6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.9 ms