Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed5Q9CXE7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed5Q9CXE7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms