Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prkrip1Q9CWV6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Prkrip1Q9CWV6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prkrip1Q9CWV6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms