Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snw1Q9CSN1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snw1Q9CSN1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snw1Q9CSN1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snw1Q9CSN1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Snw1Q9CSN1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snw1Q9CSN1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snw1Q9CSN1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Snw1Q9CSN1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snw1Q9CSN1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snw1Q9CSN1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snw1Q9CSN1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snw1Q9CSN1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snw1Q9CSN1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snw1Q9CSN1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snw1Q9CSN1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snw1Q9CSN1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snw1Q9CSN1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snw1Q9CSN1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snw1Q9CSN1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snw1Q9CSN1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Snw1Q9CSN1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snw1Q9CSN1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snw1Q9CSN1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snw1Q9CSN1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snw1Q9CSN1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snw1Q9CSN1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snw1Q9CSN1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms