Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRY7

Gdpd1, Lysophospholipase D GDPD1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd1Q9CRY7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gdpd1Q9CRY7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gdpd1Q9CRY7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gdpd1Q9CRY7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Gdpd1Q9CRY7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gdpd1Q9CRY7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gdpd1Q9CRY7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gdpd1Q9CRY7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Gdpd1Q9CRY7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gdpd1Q9CRY7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gdpd1Q9CRY7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gdpd1Q9CRY7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gdpd1Q9CRY7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gdpd1Q9CRY7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gdpd1Q9CRY7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gdpd1Q9CRY7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gdpd1Q9CRY7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Gdpd1Q9CRY7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gdpd1Q9CRY7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gdpd1Q9CRY7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gdpd1Q9CRY7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gdpd1Q9CRY7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Gdpd1Q9CRY7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Gdpd1Q9CRY7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gdpd1Q9CRY7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gdpd1Q9CRY7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gdpd1Q9CRY7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gdpd1Q9CRY7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gdpd1Q9CRY7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gdpd1Q9CRY7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
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Gdpd1Q9CRY7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gdpd1Q9CRY7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gdpd1Q9CRY7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gdpd1Q9CRY7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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Gdpd1Q9CRY7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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Gdpd1Q9CRY7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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Gdpd1Q9CRY7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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Gdpd1Q9CRY7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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Gdpd1Q9CRY7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gdpd1Q9CRY7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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Gdpd1Q9CRY7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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Gdpd1Q9CRY7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gdpd1Q9CRY7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Gdpd1Q9CRY7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdpd1Q9CRY7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdpd1Q9CRY7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms